A Câmara Técnica de Saneamento foi criada em 1998 por meio da Deliberação CBH-TJ 02/1998. Suas principais atribuições são:

• Acompanhar os estudos de planejamento e gerenciamento, em elaboração na área de saneamento, de interesse para a região, emitindo pareceres e relatórios técnicos para subsidiar as decisões do CBH-TJ;
• Promover estudos, divulgação e debates dos programas prioritários de ações, serviços e obras a serem realizados no interesse da coletividade no campo do saneamento;
• Articular com a Câmara Técnica de Planejamento e Gestão do CBH-TJ, visando a compatibilização dos programas de saneamento e recursos hídricos da Bacia.

A CT-SAN foi a responsável pela identificação, idealização e proposição de importantes projetos, listados a seguir:

• Diagnóstico de Contaminação por Agrotóxicos na Bacia Hidrográfica UGRHi 13 (Em parceria com a CT-RN) – Em andamento;
• Planos de redução de perdas em sistemas de abastecimento municipais.